carbamazepine 能治疗胰腺癌吗?
Robertium 通过分析 167,145 篇生物医学论文,找到了 856 个这样的跨领域药物再利用候选。目前尚无一个有临床试验。全部都有已发表文献中的证据链。
开源。可复现。经 PubMed 验证。
{
"drug": "carbamazepine",
"drug_domain": "epilepsy",
"mediator": "KRAS",
"outcome": "pancreatic ductal adenocarcinoma",
"outcome_domain": "pancreatic_cancer",
"score": 0.300,
"evidence_papers": 4,
"clinical_trial_status": "none",
"literature_status": "novel_signal"
} 问题
每天有超过 4000 篇生物医学论文发表。知识在期刊、学科与语言之间保持碎片化。能带来新疗法的关联往往早已存在于已发表的文献中,但没有任何人类团队能系统地找到它们。
方法
Robertium 阅读开放的生物医学文献,提取关于药物、基因与疾病的结构化论断,并把它们连接成知识图谱。从这张图谱中,它浮现出指向新药物再利用假说的矛盾、空白与推理链。
流程与领域无关。当前在十个治疗领域运行:胶质母细胞瘤、癫痫、ALS、阿尔茨海默病、胰腺癌、重性抑郁障碍、多发性硬化、2 型糖尿病、类风湿关节炎与炎症性肠病。新领域可在数天内加入,而非数月。
阅读
来自 OpenAlex、PubMed、bioRxiv 的开放生物医学文献
提取
通过语言模型提取关于药物、基因、疾病的结构化论断
连接
知识图谱揭示矛盾、空白与推理链
开放
Robertium 是采用 MIT 许可证的开源项目。代码、提取的论断与知识图谱全部免费可得。
这是有意为之。药物发现的基础设施应当属于科学社区,而非私有平台。
精选假说
顶尖的跨领域候选,此前没有直接证据将药物与结果相连——通过共享的分子媒介浮现。每张卡片通向完整的证据链。
提示 curcumin(一种阿尔茨海默病药物)结合 TDP-43,而后者关联于 ALS。
提示 Auranofin(一种类风湿关节炎药物)抑制 TDP-43,而后者关联于 ALS。
提示 metformin(一种2 型糖尿病药物)激活 AMPK,而后者预防 metabolic dysfunction。
提示 erlotinib(一种胰腺癌药物)抑制 EGFR,而后者关联于 glioblastoma。
提示 resveratrol(一种heart failure药物)激活 SIRT1,而后者升高 proliferation。
提示 auraptene(一种胶质母细胞瘤药物)下调 MMP-9,而后者关联于 epilepsy。