Методология

Метод Свенсона ABC: патоген A — общий переносчик B — патоген C. Связь A↔B и связь B↔C каждая взята из EPPO; вывод A↔C — это гипотеза о возможной общей уязвимости через переносчика.

A берутся из регулируемых карантинных списков (РФ, Великобритания, Турция — единственные с непустыми списками в EPPO API; списки ЕС централизованы и через API не отдаются). C — это все патогены, ассоциированные с тем же переносчиком в EPPO.

Объём: 99 регулируемых патогенов в роли A, 264 цепочки в основном каталоге.

Единственный источник данных — EPPO Global Database. Каждая цепочка опирается на две библиографические ссылки EPPO: на ребро A↔переносчик и на ребро переносчик↔C.

Названия патогенов, переносчиков и культур на сайте кликабельны и ведут на страницы таксонов EPPO; часть источников ведёт прямо на публикацию по DOI.

• Вектор (основной мост). Специфичность вектора = 1 / число патогенов, которых он переносит. Чем уже круг переносимого, тем осмысленнее связь.
• Общий ареал культур-хозяев. Доля общих культур через коэффициент Жаккара (пересечение делить на объединение наборов хозяев). Берутся хозяева классов Major host и generic Host; лабораторные и сорные исключены.
• Общая география. Пересечение стран распространения A и C по EPPO.

Дважды подтверждено = вектор плюс общий ареал хозяев. Трижды = плюс совпадение по странам.

Основной каталог ранжируется по неочевидности (специфичность вектора, помноженная на новизну по удалённости семейств хозяев): наверх поднимаются связи между ботанически далёкими культурами, которые специалист не держит в голове по умолчанию.

Раздел подтверждённых ранжируется иначе — по силе подтверждения, не по неочевидности. Метка «сильное» = специфичный вектор (не более 6 переносимых патогенов) И не менее 2 общих культур И объём общих хозяев от 5 до 150 И Жаккар не ниже 0.1.

Для подтверждения метрика новизны не годится: общие хозяева здесь — признак силы связи, а не штраф (в новизне общие хозяева, наоборот, понижают балл).

• EPPO не регистрирует переносчиков для многих патогенов, особенно новых, — покрытие векторов неполное.
• Большинство записей о хозяевах — generic Host без уточнения класса; это снижает полноту моста по хозяевам.
• Сиды только из трёх стран с непустыми списками EPPO — реальная регулируемая картина шире.
• Направление переноса метод не определяет.
• Это выявление ассоциаций из литературы EPPO, а не биологический эксперимент; каждая гипотеза требует экспертной проверки.
• Конвергенция по культуре — операционный сигнал совместного риска по культуре, а не свенсоновская новизна.
• Временная динамика (когда вектор и оба патогена реально совпадали) не учитывается.